申请保密资质的条件如下：（1）须有完善的保密制度完善和健全的保密组织；（2）有专门机构或者人员负责保密工作；（3）用于涉密信息系统集成业务的场所、设施、设备须符合国家保密规定和标准；（4）从事涉密信息系统集成业务人员的审查、考核手续须完备等。
其中，涉密信息系统集成资质管理办法规定了以下内容：涉密信息系统集成企业资格的认定标准。涉密信息系统集成企业应当具有国家计算机信息系统集成三级资质，并经过保密资格审查合格，才能从事涉密信息系统集成工程的设计、施工、调试等工作；涉密信息系统集成企业资格的认定程序。
按照最新的2016年底最新发文要求现在提交材料是申请书和书面审查表同时递交。
保密资质分三种，分别是：甲级、乙级和单项三种资质。甲级资质单位可在全国范围内从事涉密系统集成业务。乙级资质单位仅限在所批准的省、自治区、直辖市所辖行政区域内从事涉密系统集成业务。
1、首先，企业需具备清晰、明确的变革发展历程，并在取得四级资质后至少满一年，且从事系统集成业务的时长不得少于两年，方能申报三级资质。
2、计算机信息系统集成企业资质等级评定条件实施细则中，对申请二级资质的企业有明确的要求。企业需有清晰的变革发展历程和明确的产权关系，以确保业绩、人员和资产的继承关系以及股权关系的明晰。企业申请二级资质的资格取决于其在获得三级资质后至少满一年，或从二级降为三级后，现有三级资质证书的获证时间满半年。
3、企业需明确成立时间、产权关系和变更事项中的继承关系，以及取得二级资质的时间不少于两年。计算机信息系统集成服务需涵盖咨询设计、集成实施、运营维护等多个环节，系统集成收入需单独核算。营业收入应区分系统集成收入、其他IT类收入和非IT类收入。
